1、安装与配置
下载安装:从官方网站(如https://www.asperasoft.com/)下载适用于您操作系统的Aspera Connect软件,并按照提示完成安装。
环境变量设置:在Windows系统中,右键点击“此电脑”->属性->高级系统设置->环境变量,在用户变量区域,新建变量名“ASPERA_SCP_PASS”,变量值为NCBI提供的aspera.openssh文件的存储地址;在Path变量处,点击编辑,新建地址,添加aspera的安装地址,并记得文件夹中间不要有空格且文件名记得重命名。
Linux版本安装:可以使用wget或curl命令下载Linux版本的Aspera,解压后运行安装脚本,如bash./ibm-aspera-connect_4.2.0.42042_linux-64.sh
,然后按照提示进行安装。
2、数据上传
切换到Aspera目录:打开命令提示符(Windows)或终端(Linux),使用cd
命令切换到Aspera的安装目录,例如cd C:\Users\Administrator\AppData\Local\Programs\IBM\AsperaConnect\bin
。
准备上传文件:将需要上传的文件放在一个文件夹中,并记录该文件夹的绝对路径。
执行上传命令:在命令行中输入上传命令,格式为ascp -i ".aspera.openssh" -QT -l 100m -d <subasp>@upload.ncbi.nlm.nih.gov:/uploads/zxz1006_gzucmedu.cn_k7sPagMF7.txt /path/to/your/file
,其中<subasp>
是NCBI给您的用户名,/path/to/your/file
是您要上传的文件的路径,zxz1006_gzucmedu.cn_k7sPagMF7.txt
是NCBI提供的上传专属路径和文件名,需根据实际情况修改。
3、数据下载
单个文件下载:在命令行中输入下载命令,格式为ascp -i ".aspera.openssh" -QT -l 100m -P 33001 -k 1 -d anonftp@fasp.sra.ebi.ac.uk:/vol1/fastq/SRR576/004/SRR5760814/SRR5760814.fastq.gz ./test.fq.gz
,其中anonftp
是用户名,fasp.sra.ebi.ac.uk
是服务器地址,/vol1/fastq/SRR576/004/SRR5760814/SRR5760814.fastq.gz
是要下载的文件路径,./test.fq.gz
是本地保存的文件名,可按需修改。
批量下载:先将要下载的文件路径放入一个文本文件,每行一个路径,然后在命令行中使用循环语句结合ascp命令进行批量下载,具体命令可根据实际需求编写。
Aspera是一款功能强大的文件传输工具,通过正确的安装、配置以及掌握其上传和下载的命令使用方法,能够高效地实现数据的传输,满足科研等工作中的数据传递需求,在使用过程中,需注意根据实际的网络环境和服务器要求,合理设置相关参数,以确保传输的稳定性和速度。